分子病理室现有建筑面积近400平方米，分为荧光原位杂交（FISH）室、临床基因扩增实验室Ⅰ室和临床基因扩增实验室Ⅱ室。FISH室主要用于FISH检测与判读、Ⅰ室主要用于核酸提取和荧光定量PCR检测；Ⅱ室主要用于一代测序和二代测序。实验室现有工作人员21名，博士16名，中高级职称19人。实验室于2019年通过湖北省临床检验中心技术审核，获得《临床基因扩增检验实验室技术审核合格证书》。实验室管理高效，操作准确，分子检测各项目在已经参加过的EMQN、PQCC等国际国内室间质评活动中均合格通过。实验室拥有荧光原位杂交（FISH）自动化扫描与阅片分析系统、显微切割仪、全自动核酸纯化仪、荧光定量PCR仪、Agilent 2100生物分析仪、3500DX基因分析仪、GIN16自动化建库工作站、DA8600高通量测序仪、华大MGISEQ-2000测序仪、Illumina NextSeq 550基因测序仪等各种先进的自动化设备。具备FISH、荧光定量PCR、一代测序、二代测序四大技术平台，检测项目涵盖肺癌、结直肠癌、甲状腺癌、乳腺癌、胃肠道间质瘤、淋巴瘤、恶性黑色素瘤、软组织肿瘤等，涉及肿瘤的诊断、靶向治疗患者的筛选、肿瘤治疗与预后的评估等方面，年检测量近1万例，为疑难病例的病理诊断和肿瘤的精准医疗提供了有力的保障。

在人才培养方面，实验室按照分子轮转计划对规培医生、实习生及进修生进行各个分子技术平台轮转培训，由高年资技术人员担任带教老师，遵循分层递进的原则，根据《住院医师规范化培训内容与标准》实施带教工作，鼓励学员“多看、多想、多做”。在保障分子检测安全的前提下加强训练，完成分子室培训指标和工作量，从而逐步提升学员技术操作能力。每年带教住培医师10人，实习生约5-6人，进修生约5-6人，结业考核通过率100%。